2가지 말씀을 하셨는데 우선 두번째 내용부터 답변을 드립니다.(비교적 간단한 내용이라)

예전에는 금융기관설정에서 인증서를 변경하거나 또는 지정해 주는 기능을 만들어 두었었습니다. 

하지만 지금은 금융기관설정 화면이 아닌 직접 해당 계좌에서 할 수 있도록 했습니다.

이것은 금융기관설정 메뉴를 찾아서 또한 설정하는 과정도 복잡해서 실제 고객님들이 사용하기가 어렵다는 판단을 했고 따라서 화면에 보이는 상태에서 [편집]에 의해 직접 설정할 수 있도록 만든 것이랍니다.

계정마다 바꿀 필요는 없고 같은 은행은 한번의 설정으로 모두 같이 적용이 되고 비밀번호 변경은 어느 한 은행에서 해도 똑 같이 다 적용되게 만들어 두었습니다. 따라서 보다 편리하게 이용하실 수 있을 겁니다.

첫번째 말씀하신 내용이 좀 복잡한데...

범용인증서라서 그런 것이 아니라 인증서는 어디에서 발급 받았느냐에 따라(금융기관) 저장하는 위치와 이용하는 위치등이 다른 경우가 있는데

말씀하신 것처럼 인증서가 보이지를 않는다면 인증서가 저장된 위치가 달라서 그럴 것이라 생각 합니다.

물론 이것은 머니북에서 모든 위치를 찾아서 보여주지 못하는 문제라면 문제일 수 있는 이유 때문입니다.

시간 되실 때 담당자에게 연락을 주시면 원격지원을 통해 문제를 찾아봐서 해결을 해 드리도록 하겠습니다.

대개는 문제가 없는데 문제가 되는 부분을 찾아서 프로그램에 반영을 하도록 하겠습니다.(02-6263-2637)

고맙습니다.